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中国科学院地质与地球物理研究所1999年6月由原中国科学院地质研究所和中国科学院地球物理研究所两所整合而成。整合前的两个研究所都有长达50余年的历史和丰厚的科研成果，在国内外学术界具有很高的地位。2004年将中国科学院武汉数学物理研究所的电离层研究室整体调整到所。整合原中国科学院兰州地质所，建立了中国科学院地质与地球物理研究所兰州油气资源研究中心。研究所现有在职人员480人，其中科技人员298人，具有高级职称的专业科研人员215人。有中国科学院院士11人、中国工程院院士1人，国家自然科学杰出青年基金获得者28人，中科院“百人计划”入选者17人，国家“千人计划”3人。研究所是国家最早确定的硕士、博士研究生培养基地和博士后流动站单位，是中国科学院博士生重点培养基地，有地质学、地球物理学、地质工程二级学科的博士、硕士培养点，地质学、地球物理学、地质资源和地质工程三个博士后流动站。目前在读博士生、硕士生近550多人，在站博士后约100人。电磁法仪器组是2010年新成立的一个硬件研发部门，是专门为方法理论验证提供实验仪器支持的科研支撑系统，主要从事地质学，地球物理学相关的大小仪器开发、研究、制造，目前技术水平属于国际一流水平。

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