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更新于 1月28日
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单细胞生物信息分析工程师
1-1.5万
武汉
江夏区
1-3年
硕士
全职
招1人
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立即投递
职位描述
单细胞
基因测序
生信分析
岗位职责
1. 负责单细胞组学与空间转录组学数据分析流程的研发、维护和优化,包括但不限于scRNA-seq/snRNA-seq、scATAC-seq、单细胞多组学(RNA+ATAC/CITE-seq等)、空间转录组(10x Visium HD、Stereo-seq等)、单细胞全长转录组和空间全长转录组;
2. 独立完成项目所需的分析与交付:数据质控与去噪、去双ts、批次矫正/整合、聚类与细胞类型注释、差异分析、轨迹/拟时序、细胞通讯、空间域识别与空间差异表达、空间去卷积(deconvolution)及空间可视化等,并撰写SOP与项目报告;
3. 将成熟流程进行标准化封装与自动化(如Nextflow/Snakemake等),部署到服务器/HPC/平台并完成测试、版本管理与可复现性保障;
4. 跟踪单细胞与空间组学领域的文献、算法和工具进展,结合项目目标提供更优的分析方案与可解释的生物学结论。
岗位要求:
1. 生物信息、计算生物学、生物学、医学等相关专业硕士及以上学历;有单细胞组学/空间转录组项目经验者优先;
2. 熟悉单细胞与空间转录组常用分析方法与工具生态(如Seurat/Scanpy、Cell Ranger/STARsolo、Space Ranger、wf-single-cell及相关空间分析工具等),可独立完成端到端分析;
3. 熟练使用R或Python进行数据处理、统计分析与可视化;熟悉Linux环境、脚本编写与常用生信工具链;
4. 有流程化/工程化经验者优先:Snakemake/Nextflow/WDL,Docker/Singularity,Git,HPC任务调度(Slurm/PBS等),以及良好的结果复现与交付意识;
5. 具备非模式动物或植物细胞注释相关经验,熟悉非模式物种基因组特征,能独立完成基于单细胞数据的物种特异性细胞类型注释工作;
6. 具备良好的沟通协作能力、问题定位能力和学习能力,能推动跨团队项目按期高质量交付。
工作地点
江夏区高农生物园(高新大道)武汉贝纳科技有限公司
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杨女士/人事专员
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杨女士 / 人事专员
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武汉贝纳科技有限公司
学术/科研,学术/科研,医药制造,专业技术服务
100-299人
A轮
武汉贝纳科技有限公司(下称“贝纳基因”)成立于2012年,是亚太地区最大的纳米孔测序服务商。作为国家高新技术企业,贝纳基因以纳米孔测序技术应用为核心,开发多场景测序应用方案,打造二代测序、三代测序、生物信息开发与多组学应用联合研究中心,致力于为高校、科研院所、医院、研发型企业等提供专业、快捷、全方位的检测及科研服务。以武汉为总部,贝纳基因构建了完善的全球服务网络,在武汉、香港设有高标准测序实验室,北京、南京、香港及美国等地设有分公司或办事处,生产办公面积超8000㎡。团队实力雄厚,200余人的服务团队中博士、硕士占比超过70%,核心成员曾在《Nature》《Science》系列杂志发表多篇学术成果。业务范围广泛,覆盖国内31个省市自治区、港澳台,以及美国、欧洲、中东、东南亚等海外市场,累计服务客户逾5000家。贝纳基因作为亚太地区最大的纳米孔测序服务商,在基因组应用领域,完成全球第一个大型复杂植物(菊花)的基因组测序组装,稳定向国内外客户提供读长100kb、150kb、200kb的超长片段测序和T2T基因组解决方案。在转录组应用领域,国内最早完成直接RNA测序(DRS)的商业转化,提供全球独家基于纳米孔的LncDRS测序技术及全面的转录调控研究方案。在微生物应用领域,提出并推动基于纳米孔测序的万种微生物基因组完成图计划和十万人的纳米孔宏基因组研究计划。下设全资子公司贝纳医学,专注于纳米孔测序技术的临床应用转化与分子诊断试剂开发,目前已围绕病原微生物、肿瘤与遗传三大领域推出一系列临床诊断产品。未来,贝纳基因将坚守“纳米孔测序专家”的信念,秉承“测序计算提升客户价值,基因解码服务人类健康”的使命,在生命科学研究领域,为全球合作伙伴提供高标准、可信赖的解决方案;在临床诊断领域,推出更精准、更快速的检测产品。愿景多场景测序应用方案引领者使命测序计算提升客户价值,基因解码服务人类健康核心价值观责任、诚信、学习、创新
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