岗位职责:
1、独立负责临床微生物多组学数据分析项目,涵盖微生物基因组、微生物转录组/宏转录组、蛋白组学、16S/ITS扩增子测序、宏基因组学;
2、为客户提供专业的售后技术支持,包括结果解读、个性化分析、问题排查与解决方案建议。
3、使用Snakemake等流程管理工具,构建标准化、可重复的分析管道;维护和优化现有微生物组学分析流程,提升计算效率和结果可靠性;建立临床微生物数据分析的质控标准和最佳实践指南。
4、深入挖掘微生物多组学数据与临床表型以及流行病学特征的关联;开发适用于临床样本的生物信息分析方法,处理低生物量、高宿主污染等挑战;
任职要求:
1、硕士及以上学历,生物信息学、流行病学、微生物基因组学或相关交叉学科;
2、1年以上微生物相关组学数据分析以及流程开发经验,具备分子流行病学项目经验(如病原体溯源、暴发调查、耐药性监测等)优先。
3、熟悉高通量测序数据分析流程,具备基因组、转录组、表观组等常见组学数据分析经验;熟悉病原体分子分型数据库与工具、细菌基因组组装、注释、比较基因组学以及统计建模。
4、熟练掌握至少一门编程语言(如Python/R/Shell),具备脚本编写和流程开发能力。
5、熟悉Linux操作系统及集群环境,掌握常用生物信息学工具与数据库。
6、以第一作者在相关领域发表过学术论文。