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生信软件算法管培生(肿瘤NGS方向)

1.3-1.6万
  • 北京昌平区
  • 经验不限
  • 硕士
  • 全职
  • 招3人

职位描述

高通量测序肿瘤基因测序基因组学Python生物信息学变异检测AI编程VARIANT CALLINGCURSORCOPILOT
【核心职责】
1.参与肿瘤NGS变异检测软件的全栈开发,在导师指导下快速成长为生信软件算法复合型人才。
2.熟练使用 VibeCoding 和智能体工具完成系统性的算法开发测试验证和软件工程实现。
3.负责软件的更新与维护,并解决实际应用过程中的问题,以保障公司利益不受损失。
4.负责软件的智能体化对接,及 AI 智能体相关服务的开发与维护。
【软件开发】
1.参与现有生信分析流程的代码审查与重构,提升代码质量和可维护性
2.开发变异检测相关模块(SNV/Indel/CNV/SV),实现算法到代码的快速转化
3.建立CI/CD流水线,编写自动化测试,确保代码可靠性
4.使用Docker容器化部署,支持云平台(阿里云)弹性扩展
【算法研究】
1.研究并实现主流变异检测算法,并实现整合运用
2.运用数据建模实现检测性能提升
3.优化算法性能,支持GPU加速和分布式计算
4.整合多组学数据,构建综合分析流程
5.利用 AI 及相关算法提升软件性能
【数据工程】
1.设计ETL流程,处理 FASTQ/BAM/VCF 等多格式数据
2.构建变异数据库,支持数据查询和可视化
3.建立自动化质控体系,生成质控报告
4.符合GA4GH标准,支持多中心数据共享
【临床转化】
1.理解临床需求,将算法转化为临床级应用
2.符合CAP/CLIA合规要求,建立审计追踪机制
3.开发生成自动化报告系统,支持临床决策
4.与临床产品团队协作,持续优化产品性能
【必备条件】
1. 学历背景:硕士及以上,生物信息学、计算机科学、统计学、数学等相关专业,优秀本科生(有突出项目经验)可放宽
2. AI VibeCoding能力(核心考察点)
快速学习:能在短时间内掌握新技术(请提供学习新技术的案例)
算法实现:能将算法论文快速转化为代码(请提供GitHub项目)
AI辅助编程:熟练使用 VScode 等或AI编程工具
问题解决:能独立解决技术难题(请描述最复杂的技术问题及解决过程)
3. 编程基础
Python熟练(非"了解"级别,能独立开发完整项目)
代码质量:注重可读性、有文档、有测试
Git熟练使用:分支管理、代码审查、冲突解决
4. 表达与沟通能力
技术表达:能清晰讲解项目和技术方案
文档能力:有技术博客、README文档示例
英语能力:CET-6,能阅读英文文献
【加分项-生信相关】
生物信息学课程/项目经验
了解GATK、Mutect2等工具
有单细胞/多组学分析经验
发表过生信相关论文
【加分项-AI/ML相关】
深度学习项目经验(PyTorch/TensorFlow)
Kaggle竞赛经历
顶会论文发表

工作地点

昌平区北京吉因加医学检验实验室有限公司

认证资质

营业执照信息

职位发布者

刘洁/HRBP

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公司Logo北京吉因加医学检验实验室有限公司
吉因加科技创立于2015年4月,在北京、苏州、深圳三地建立医学检验实验室、基因研究院、医疗器械产业化基地等多家实体机构,现有员工1000余人,运营面积14000余平米。公司聚焦肿瘤精准医疗,基于高通量测序NGS检测和肿瘤基因大数据平台,布局肿瘤防治全链条,打造临床检测服务、医疗器械制造、科技合作服务、肿瘤防治服务四大业务板块,致力于成为最值得信赖的肿瘤基因大数据服务平台。
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